Radni programi u sklopu programa Obzor Europa pružaju konkretan pregled dostupnih mogućnosti financiranja.
Glavni radni program uključuje:
- Akcije Marie Skłodowska-Curie i istraživačku infrastrukturu u okviru Stupa I
- Sve klastere u okviru Stupa II
- Europske inovacijske ekosustave u okviru Stupa III
- Širenje sudjelovanja i jačanje Europskoga istraživačkog prostora
Ostali radni programi obuhvaćaju:
- Europsko istraživačko vijeće (ERC)
- Zajednički istraživački centar (JRC)
- Europsko vijeće za inovacije (EIC)
Značajan dio Stupa II programa Obzor Europa provodit će se putem institucionaliziranih partnerstava, osobito u područjima mobilnosti, energije, digitalnih tehnologija i bio-gospodarstva, za koja će također biti izrađeni posebni radni programi.
Aktivnosti Europskog instituta za inovacije i tehnologiju (EIT) definirane su u odvojenim programskim dokumentima.
Program Obzor Europa također se provodi kroz još jedan poseban program – Europski obrambeni fond (EDF) – te ga nadopunjuje i Euratomov program za istraživanje i obuku. Za svaki od ovih programa predviđeni su zasebni radni programi.